办公室：负责文件起草；公文、审批文件的运转、审核、发送；各类活动组织；工作督导及后勤管理工作。

人事科：负责工资、“五险一金”、职业年金管理；员工教育培训及退休干部职工管理工作。

宣传科：负责企业文化建设、宣传报道及信息报送工作。 

法纪科：负责涉水法律、法规及条例等相关政策的组织学习；员工工作纪律检查等工作。

财务科：负责各类财务事项会计核算和监督、票据归档、财务报表的制作、汇总、建档保存工作。

技术科：负责室内外新建、改扩建供水工程的勘测设计、工程预算、质量监督、竣工验收工作；二次供水设备、远传水表管理；用户报装受理、入户、变更及资料审核、建档；项目信息报送及项目专项资金使用和管理工作。

水费收缴处：负责城区用户水表抄录、水表井及其附属设施的巡查、违规用水上报、新安装户阀门开启工作。

供水中心：负责供水设施运行及其设备维修维护工作。

水务综合服务大厅：负责水费收缴、水费回收数据统计及财务入账工作。

公共事业执法中队：负责依法对违规用水和破坏水务工程设施的查处、用户投诉处理工作。

维修所：负责城区供水管网及附属设施维修维护工作。

水质监测中心：负责城区供水水质化验工作，水样送检及水质档案管理工作。

商丘市碧源市政公用工程有限公司：负责市政施工安装、水务安装市场拓展、工程招投标、零星土建工程施工工作。

污水处理费征收处：负责城区机关企事业单位、建筑业、特种行业及小区自备井用户的污水处理费征收工作；污水处理费使用和财务管理工作。

龙门污水净化有限公司：负责城区污水厂运行管理工作。